顺应潮流：仅血浆ctDNA-MRD检测的应用现状！

"酪氨酸被设为MRD检测的发展前景是明确的，期望这些进展将暂时提极低将来MRD检测的稳定性。"

结核病的MRD检测是一种灵敏且特异的用作检测结核病病征血液中但会源性遗传物质（如ctDNA）相对数量的原理。在这种稳定状态下，病征很难肉眼可见的肿病变，但或许不存在新标准诊断影像原理很难检测到但再度但会加剧结核病病情恶化的均匀分布肿病变。

MRD，常称为均匀分布残余肿病变（Minimal Residual Disease）。用作“Minimal” （均匀分布）这个词，是因为它在文献和诊断专家中但会格外常用。不过，“Minimal”这个词有可能不具“虚假”，因为低极低度的病变在病因和疗法决策方面也有可能不具关键含义。“Measurable”（可量度）一词可格外精确地描述残余在治疗体内的抗体的不存在。NCCN最新同时用作了“Minimal Residual Disease”（均匀分布残余肿病变）和“Measurable Residual Disease”（可量度残余肿病变）两个名词。

此外，可行性深入研究表明在分子会极低度上检测多种结核病各种类型的ctDNA举例来说不具诊断效用，文献和诊断专家有时也但会用作“Molecular Residual Disease”（分子会残余肿病变）一词。

近期，国内外在虚拟中但会基于ctDNA的MRD审计（ctDNA-MRD）的诊断比对和确实愈来愈多，开启了虚拟病变MRD检测的热潮。虚拟病变ctDNA-MRD检测的系统设计精髓主要有两大类：

1）Tumor-informed assays（知情比对分析）

对原发其组织透过DNA以解剖病征的特异性状组突变图解，然后设计引物定制panel或用作单独panel透过个性化的ctDNA检测比对分析。

2）Tumor-uninformed assays（不知情比对分析）

也可以称为Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays，即不须原发其组织，有数依赖于三组先选定引物/探针设计的与结核病各种类型就其的单独panel透过ctDNA检测比对分析，平常检测ctDNA性状的同时，借助于ctDNA酪氨酸或段落组学等多组学原理。显然了其组织比对过剩或检测位点过剩或TAT过长等问题。

Tumor-informed assays的系统设计策略格外符合大众的知觉，在某种程度极低酪氨酸的某种程度下，可通过检测多位点的sample-level（比对极低度）充分并用其频率，系统设计如此一来相对来说不是尤其极低。Tumor-uninformed assays的系统设计策略格外类似于早筛，通过提极低site-level（位点极低度）检测频率并借助于ctDNA酪氨酸或段落组学并相结合机器学习搜索算法充分并用其频率和酪氨酸，系统设计如此一来相对来说较极低。

2021年4月底29日，《Clinical Cancer Research》在线发表了“仅简单作肝脏ctDNA检测结胃癌病征均匀分布残余肿病变（MRD）”的篇名，首次公开了Guardant Reveal的深入研究比对：MRD检测频率达到91%，酪氨酸达100%，这些发现支持了有数肝脏ctDNA-MRD检测（Tumor-uninformed assays）的潜在诊断系统设计。

2021年8月底13日，《Clinical Cancer Research》在线发表了“顺应潮流：有数肝脏ctDNA-MRD检测的系统设计前景”的篇名，在这里实证们讨论审计了有数肝脏ctDNA检测MRD的能力，以及将酪氨酸拆分到ctDNA检测的潜在好处。2

Parikh及其助手1 和Taieb及其助手3 讨论了有数肝脏ctDNA-MRD检测在结胃癌（CRC）病征中但会的潜在诊断系统设计。

▲ ctDNA酪氨酸和性状在两项深入研究中但会的系统设计比较（Parikh和Taieb）

结胃癌（CRC）的疗法仅仅面临着一个关键时刻，即相当多的CRC病征因晚期疾病病情恶化而则会丧命。尽管诊断有别于了新标准的来透过疗法，但极低风险IIIC期CRC病征的5年生存率也有数有53%，即使如此是很难发现放大镜上仍未检测到的均匀分布残余肿病变（MRD）。4

现今，仍迫切即可要精确未确定哪些病征术后不存在MRD，以帮助监督减少或增加来透过疗法，并增加治愈的有某种程度，同时最大限度地减少避免疗法的就其致癌性。

在过去的几年里，我们对ctDNA在CRC诊断和病因中但会的系统设计有了较广的知晓。现今，基于ctDNA的MRD审计亦然较广系统设计于结核病的疗法中但会。

ctDNA是由DNA的短段落组成（大约130-150bp），由抗体通过凋亡、炎症或分泌物扣留到循环系统中但会。 ctDNA的半衰较短致使其成为敏感的动态负荷多种类型，它的不存在有可能反映了放大镜上看不见的微转移。

在治愈性疗法落幕后，ctDNA中但会成现的细胞核性状对随后的放大镜病情恶化不具较极低的阴性预期价值，尤其是当这些性状与截肢的其组织中但会的性状相一致时。检测这种ctDNA判别的MRD可以在I-III期CRC中但会提前放大镜数月底预期病情恶化，从而为三组再度但会病情恶化的CRC病征备有一个审计新疗法的窗口。然而，这些ctDNA基础性状判别的MRD检测原理的频率仅仅是依赖于的，迫切即可要改进其检测稳定性。

ctDNA的酪氨酸检测优于ctDNA的基础性状检测。ctDNA的酪氨酸所致在CRC中但会非常常见，并被看做大多数癌变的晚期收尾。这种酪氨酸，具体判别为DNA中但会赖氨酸的C5一段距离替换成甲基基团，调节附近性状的表述，之外经典的矜癌性状失活。与基础性状相比之下，CRC中但会不存在格外多的酪氨酸所致区域，为提极低MRD检测的频率备有了机但会。SEPT9，就是第一个并用血液检测单性状酪氨酸所致透过临床深入研究和晚期检测CRC的原理。尽管ctDNA酪氨酸有这些优点，但这些相同的特性也即可要慎重，以保有检测比对分析的酪氨酸，并能避免假阴性的有某种程度。

在这种背景下，Parikh和Taieb的原则上最新深入研究结果为我们对ctDNA稳定性的理解备有了简单的补充，即不须原发其组织，有数通过血液ctDNA酪氨酸或联合ctDNA性状即可透过精确的MRD审计。与其他即可要对原发其组织透过DNA以监督后续ctDNA比对分析的检测多种不同，原则上深入研究探讨了Tumor-uninformed assays的必要性，它有几个军事优势，之外快速的TAT，降低初始开发成本，对其组织过剩或不可用的病征透过检测。

Parikh等人备有了一种ctDNA酪氨酸相结合ctDNA基础性状的单独panel透过MRD的比对分析审计（NGS原理），与其他赢利上可用的MRD检测原理相比之下，这种原理不即可要截肢的其组织以及定制化。在再度疗法后用作时，这种有数肝脏ctDNA-MRD检测对病情恶化不具诊断含义的酪氨酸（100%）和频率（55.6%），通过拆分密切就其性状组特质和垂直检测比对分析，其频率可充分并用至91%。1 该原理被用作亦然在透过的必要性深入研究，之外监督IIA期肺癌疗法决策的NRG合作开发组深入研究（NCT04068103）。虽然还即可要额外的比对集来实验者这些发现，但这些结果证明了基于ctDNA的MRD检测在不知情的才会可给与的检测稳定性特质。

Taieb等人的深入研究并用了一对先前被证明是CRC截肢后病因就其的酪氨酸性状标示物WIF1和NPY（ddPCR原理），并将它们系统设计于PRODIGE-GERCOR IDEA-France检验，将III期CRC病征随机分为3个月底 vs 6个月底的来透过化疗。在对参与III期检验的III期CRC病征透过的首次ctDNA-MRD审计中但会，有13.8%的病征术后为ctDNA-MRD阴性，并被获知为独立的病因多种类型。3 同时，实证也指成，与其他有别于NGS原理的ctDNA-MRD深入研究相比之下，本深入研究中但会ctDNA的阴性率高。频率和PPV举例来说低于NGS检测结果，ctDNA-MRD阴性和有性的5年DFS都为65%和73%，尽管来透过疗法的和不理想的前比对分析比对处理有可能但会对这些结果产生不良影响。该原理值得注意的是其相对简单，非常低的开发成本和潜在的再现性，不即可要赢利检测中但会所见的专利检测原理。亦然在透过的必要性深入研究将更进一步审计有数肝脏ctDNA检测到底能够精确审计MRD，以便对CRC病征透过风险分层，并监督来透过疗法决策。

无论有别于何种原理，仅简单肝脏ctDNA-MRD检测来监督CRC病征的疗法决定，即可要可靠且精确的检测原理。即可充分并用有数肝脏ctDNA-MRD检测的频率来未确定哪些病征可以从疗法降级中但会单单，以避免不恰当地选择极低危病征给与高准确度的疗法。Parikh及其助手的深入研究结果表明，拆分性状组和密切就其性状组以及垂直肝脏检测，可显著提极低有数肝脏ctDNA-MRD的频率。相比之下之下，ctDNA-MRD检测的极低酪氨酸对于ctDNA作为一个完备的生物多种类型来未确定疗法适配是至关关键的。由于酪氨酸过剩，假阴性的ctDNA-MRD有可能但会使病征给与避免的增强疗法。Parikh及其助手的深入研究结果证明，除基础性状外，还可以通过相结合密切就其性状组酪氨酸特质的比对分析来保有酪氨酸。Taieb等人的比对分析原理的军事优势在于提极低了诊断特质的频率和病因，但是，亦然如实证声称的那样，除此以外的两个性状酪氨酸标示有可能很难备有与相结合基础性状原理的稳定性特质。关键的是，这项工作也强调了新标准化比对分析前前提条件的关键性，因为各种提取原理可以在很大素质上不良影响ctDNA的得率和无损。在仍未来的深入研究中但会，这些比对分析前的考量将趋于愈来愈关键。

酪氨酸被设为MRD检测的发展前景是明确的，期望这些进展将暂时提极低将来MRD检测的稳定性。总之，有数肝脏ctDNA-MRD的检测备有了一个独具的机但会，用作一种无创原理来探索疗法方案，并有有可能遏止极低危病征的微转移性肿病变。这些深入研究结果无疑为仍未来ctDNA-MRD监督的必要性诊断检验铺平了路面。

MRD，仅仅是一个快速拓展的各个领域，我们预计近两年有可能但会成现新的确实，要么标示出成MRD检测的诊断效用的局限性，要么标示出成MRD检测的其他军事优势和新可作。

简介：

1.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siregna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

2.Bent A, Kopetz S. Going with the Flow: The Promise of Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assays. Clin Cancer Res. 2021 Oct 15;27(20):5449-5451.

3.Taieb Julien,Taly Valerie,Henriques Julie et al. Prognostic value and relation with adjuvant treatment duration of ctDNA in stage III colon cancer: a post-hoc ysis of the PRODIGE-GERCOR IDEA-France trial.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

4.Benson Al B,Venook Alan P,Cederquist Lynette et al. Colon Cancer, Version 1.2017, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.[J] .J Natl Compr Canc Netw, 2017, 15: 370-398.